第一部 「ご唱和ください我の名を side-Z」

ウルトラマンゼロから”ニュージェネレーションウルトラマンケープ”を授かったウルトラマンゼット。
ゼットは今、惑星イアリムでウルトラマンの歴史を学んでいる最中だ。そんな中で自らの「始まりの戦い」を振り返ってみることに。
あの戦いで自分は何を得たのだろう。初心を思い返す時、ゼットは何を想うのか。

第二部 「旅立ちの時」

ゼットがかつて守り抜いた地球。
彼が去った後も未だ終わらない怪獣との戦いの日々を打開すべく、研究を続けている地球人たち。
そんな彼らの前に異次元からの脅威が立ち塞がった！次々と襲い来る超獣たち。
果敢に立ち向かう特空機だが、多勢に無勢で太刀打ちできない…！大ピンチの地球にあの英雄が帰ってくる…！
みんなで一緒に、ご唱和ください！彼の名を！！